Pregunta abierta: Ayudacon discos duros?

Es una larga historia, le instale linux a mi compu y no podia entrar a windows entonces le quite linux pero no pude a ninguno de los dos sistemas operativos entonces compre un disco duro externo y le instale windows xp professional sp2, pero a la hora de correrla desde el externo me a parece un error entre los discos duros y al interno le cambie los pines y todo pero cuando la quise prender de nuevo no prendia, solo prende con el externo pero sale el error, ahora mi problema es que puedo prender mi compu con el externo y con el interno, solo con el externo y no se que hacer porfa ayudenme